臺式低速冷凍離心機的積水問題原因有多種，只要及時處理就不會造成嚴重的事故。首先，由于低速冷凍離心機運轉時使用制冷，由于空氣的水分在離心腔內結霜，停機后霜化為水。因沒有排水孔，離心腔中水愈積愈多。對于該情況，用戶應自行拆下轉子，清理積水。重新安裝轉子時一定要裝好，避免出事故。對斷軸事故轉子可能沒安放好，或裝樣品不平衡超過量太大，離心機開動。進口離心機雖都有不平衡保護，即當不平衡量超過某一*，應自動斷電，令離心機停轉。但在上述情況下，會出現惡性事故。惡性事故之一是斷軸，冷凍離心機轉子一般是用鋁合金制造，當受腐蝕后強度降低，容易出事故。
除對臺式低速冷凍離心機的電路、電子線路和機械轉動部分做常規檢查維修外，注意各種指示燈有無損壞和老化，一定要定期保養。保持離心杯對稱平衡。如離心腔內放置的樣本管不平衡，會引起離心機抖動移位。停機復位后，要檢查儀器是否正常。離心機蓋門栓，要經常檢查，保持靈活，防止強行開或關。當出現異常時，要及時維修更換。平時要加強注意觀察，及時排除解決。防止放射性同位素對儀器的污染，要仔細觀察樣本管有無裂痕或沙眼，以免離心時液體滲出。放入離心杯的塑料管動作要輕，防止液體濺出，如液體進入離心杯造成離心機腔內污染，應立即將離心杯取出，用自來水反復沖洗并晾干，同時還應該對離心機腔內進行全面清潔。
